2025年8月1日，我所彭俊平團隊在《Analytical Chemistry》在線發表了題為“Development of a CRISPR/Cas-Based Detection Platform for Tracking Decreased Susceptibility to Cephalosporins in Neisseria gonorrhoeae”的研究論文。

淋病已成為日益嚴峻的公共衛生挑戰，淋球菌抗微生物藥物耐藥性的快速演變給臨床治療帶來嚴峻考驗，特別是頭孢菌素耐藥分離株的不斷涌現，嚴重影響了淋病的有效防治，因此被WHO列入需要研發抗菌藥物的優先細菌清單（2017、2024）。目前常規檢測方法存在耗時長、流程復雜等問題，難以滿足淋球菌早期篩查和耐藥菌株及時監測的臨床需求。彭俊平團隊長期致力于病原體檢測技術研究，基于納米孔測序(Clin Chem, 2021; Sci China Life Sci, 2024)、核酸質譜(J Antimicrob Chemoth, 2020a)、高分辨率熔解曲線(J Mol Diagn, 2020，J Antimicrob Chemoth, 2020b; Antimicrob Agents Chemother,2022, 2024; Int J Antimicrob Agents, 2023)、基因編輯(Chem Eng J, 2024)等技術構建高效的淋球菌耐藥監測技術體系，為提升檢測、監測水平提供有力工具。

本研究中，彭俊平團隊成功研發了一種集成RPA-CRISPR/Cas12a的多重檢測分析技術（MIRCA），用于監測全球關注的淋球菌FC428耐藥克隆，同時發現對頭孢菌素敏感性降低的淋球菌。MIRCA技術可在40分鐘內實現淋球菌的鑒別和重要耐藥相關突變位點（penA-375-377, penA-A311V, penA-A501V/T）的檢測，并具備良好的特異性和靈敏度（10-20拷貝/反應）。臨床評估結果顯示，MIRCA 與 qPCR 方法在淋球菌鑒定方面一致率達到 100%；與 Sanger 測序相比，MIRCA 對馬賽克結構的檢測一致率為 99.17%；對 FC428克隆相關菌株的檢測準確率達 100%；對 penA-A501 突變（A501V/A501T）的檢測一致率為 98.33%。為推動MIRCA在低資源地區使用實現淋球菌的及時檢測，本研究創新性地將RPA-CRISPR技術與3D打印微流控芯片相結合，實現微流控芯片平臺與液體體系的檢測結果完全一致，準確率達到100%。

MIRCA技術不僅具備快速、精準的檢測優勢，還具有經濟高效的特點。該技術與微流控芯片的集成，提供了一種成本低廉且用戶友好的診斷方案，為資源有限地區的即時檢測提供了重要工具。該技術的應用將提升淋病耐藥性監測的效率，助力臨床及時診斷和治療決策，同時為公共衛生監測和抗菌藥物管理提供有力支持。該技術也為其他傳染病的快速檢測與耐藥性監測提供了可借鑒的技術范式，具有廣闊的應用前景。

圖.RPA-CRISPR/Cas12a多重檢測分析技術檢測淋球菌的示意圖

研究得到了中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程（2021-I2M-1-038和2023-I2M-2-001）、中國醫學科學院中央級公益性科研院所基本科研業務費專項資金項目（2019PT310029、2023-PT310-04）等項目的支持。中國醫學科學院病原生物學研究所彭俊平研究員為本文的通訊作者，博士生趙子淵為本文的第一作者。