淋病是世界常見的性傳播疾病之一，其病原體淋球菌的耐藥性作為嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題受到重點(diǎn)關(guān)注。淋球菌的耐藥機(jī)制十分復(fù)雜，已知的耐藥相關(guān)位點(diǎn)分布在十余個(gè)耐藥基因中，并且呈現(xiàn)為單核苷酸多態(tài)性、馬賽克樣變異、質(zhì)粒獲得等多種形式。因此，對(duì)一株淋球菌的耐藥特征進(jìn)行完整描述，需要對(duì)十余個(gè)耐藥相關(guān)基因測(cè)序。如果使用常規(guī)的PCR-Sanger測(cè)序技術(shù)，必須首先在臨床樣本中分離到淋球菌，然后完成大量的重復(fù)實(shí)驗(yàn)和序列分析，十分繁瑣。

為了解決上述問題，彭俊平課題組基于納米孔測(cè)序技術(shù)平臺(tái)，應(yīng)用多重PCR擴(kuò)增子測(cè)序的策略，僅使用一個(gè)PCR反應(yīng)就可以在臨床樣本中直接擴(kuò)增與淋球菌耐藥性相關(guān)的十余個(gè)基因。利用測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行互相校正，測(cè)序的準(zhǔn)確度可以達(dá)到99.5%以上，檢測(cè)的靈敏度可以低至31拷貝/微升。同時(shí)分析12個(gè)臨床樣本，只需要7-10個(gè)小時(shí)的時(shí)間就能得到耐藥相關(guān)基因的全序；而對(duì)已分離的菌株進(jìn)行檢測(cè)則需要的時(shí)間更短。

該方法建立之后，可以作為一個(gè)通用的流程推廣到其他重要病原體，分析其耐藥及分子流行病學(xué)特征，例如應(yīng)用于一些生長(zhǎng)緩慢、難以培養(yǎng)的病原體，包括結(jié)核分枝桿菌、支原體、衣原體、病毒等。該方法可以作為細(xì)菌耐藥實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)體系中的重要一環(huán)，為指導(dǎo)臨床合理使用抗生素、探索病原體耐藥機(jī)制提供新的策略與思路。研究得到中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程和國(guó)家自然科學(xué)基金的資助。