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鄭建華副研究員等在《Molecular & Cellular Proteomics》雜志在線發(fā)表關(guān)于母牛分枝桿菌的基因蛋白質(zhì)組及免疫組分的研究結(jié)果
結(jié)核病是危害人類健康的主要傳染病之一,是當今世界上傳染病中的主要殺手,我國結(jié)核病疫情日趨嚴重,防控形勢非常嚴峻。目前用于預(yù)防結(jié)核病的卡介苗對成年人的肺結(jié)核幾乎沒有保護力,近年來全球正在研發(fā)疫苗,如結(jié)核減毒活疫苗、BCG重組疫苗、結(jié)核亞單位疫苗以及DNA疫苗等臨床試驗效果均不理想。目前,母牛分枝桿菌(Mycobacterium vaccae)疫苗是近90年來針對結(jié)核病僅有的一個進入III期臨床試驗的免疫治療性疫苗,其商品名稱為微卡。盡管其應(yīng)用前景非??春?,但是關(guān)于此疫苗株的基因組、蛋白質(zhì)組、免疫抗原組份等背景都不清楚。
金奇課題組的鄭建華副研究員等采用第二代深度測序(next-generation sequencing (NGS) technologies)結(jié)合第三代測序技術(shù), 對微卡的全基因組序列進行了測定,同時利用凝膠電泳結(jié)合高分辨率、高精確性的傅里葉轉(zhuǎn)換質(zhì)譜,對微卡的蛋白質(zhì)組進行了系統(tǒng)、全面的分析,鑒定出3387個可信度極高的蛋白,其中581個基因組中編碼的“hypothetical proteins” 在蛋白水平得到了驗證。同時確認了445個蛋白的翻譯起始位點,更正了98個蛋白的起始位點。更有意思的是,首次發(fā)現(xiàn)了38個在基因組注釋中漏掉的“新”蛋白。結(jié)合蛋白質(zhì)組和基因組測序結(jié)果,采用蛋白組基因組學(xué)方法,首次獲得微卡的基因組精細圖譜和準確的注釋。
隨后采用免疫蛋白質(zhì)組學(xué)方法,利用活動性肺結(jié)核病人的血清樣本,初步篩選并鑒定出35個免疫抗原候選物,將其中的20個編碼基因進行克隆和表達,純化后的蛋白與100個結(jié)核病人的血清樣本進行體液免疫驗證,其中的8個能產(chǎn)生較強的陽性免疫反應(yīng)。進一步進行細胞免疫分析后發(fā)現(xiàn),其中的一個蛋白,MYVA_1927,也具有較強的細胞免疫活性。這是首次從體液免疫和細胞免疫水平鑒定出微卡的多個免疫原,有利于進一步深入地闡明微卡刺激宿主產(chǎn)生免疫保護的機制,為研究具有我國自主知識產(chǎn)權(quán)的疫苗提供了理論基礎(chǔ)和科學(xué)依據(jù)。
文章題目:Proteogenomic analysis and discovery of immune antigens in Mycobacterium vaccae.