2025年2月19日我所吳志強(qiáng)團(tuán)隊(duì)與華東師范大學(xué)何桂梅團(tuán)隊(duì)聯(lián)合在Molecular Biology and Evolution雜志在線發(fā)表了題為“Avian Migration-Mediated Transmission and Recombination driving the Diversity of Gammacoronaviruses and Deltacoronaviruses”的論文。

隨著COVID-19等動(dòng)物源性傳染病的暴發(fā)，野生動(dòng)物攜帶病毒的潛在風(fēng)險(xiǎn)受到越來越多的關(guān)注。蝙蝠、鼠類等野生動(dòng)物是多種高風(fēng)險(xiǎn)病毒的天然儲(chǔ)存宿主，而候鳥作為跨洲際遷徙的生物類群，可能在病原體的全球擴(kuò)散中發(fā)揮了重要作用。研究團(tuán)隊(duì)圍繞東亞-澳大利亞遷徙路線的重要經(jīng)停站上海的崇明東灘濕地、九段沙濕地和南匯東灘濕地，以系統(tǒng)分析2019年4月-2023年4月期間遷徙鳥類群體的病毒組特征為基礎(chǔ)，進(jìn)一步研究了372份冠狀病毒陽性樣本。系統(tǒng)發(fā)育分析揭示這些病毒隸屬于5個(gè)與鳥類相關(guān)的冠狀病毒亞屬，并展現(xiàn)出高度的遺傳多樣性與復(fù)雜的重組特征；為構(gòu)建更全面的鳥類冠狀病毒進(jìn)化框架，研究團(tuán)隊(duì)整合全球范圍內(nèi)可獲取的鳥類冠狀病毒數(shù)據(jù)，通過本研究新發(fā)現(xiàn)的3種冠狀病毒以及重新分類的1個(gè)病毒種，將鳥冠狀病毒的種類由12種擴(kuò)展至16種；研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)雁形目（Anseriformes）、鸻形目（Charadriiformes）和鵜形目（Pelecaniformes）的遷徙鳥類是Gamma和Delta冠狀病毒的主要宿主，強(qiáng)調(diào)了候鳥的關(guān)鍵宿主地位，而家鴨（domestic ducks）在遷徙鳥類與非遷徙鳥類之間的病毒傳播過程中發(fā)揮了重要的橋梁作用。該研究創(chuàng)新性地以一個(gè)采樣點(diǎn)的長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)反映了全球遷徙鳥類冠狀病毒的復(fù)雜遺傳進(jìn)化和傳播動(dòng)態(tài)，為我國前瞻性預(yù)該類病毒的跨境輸入和輸出提供了數(shù)據(jù)和技術(shù)支撐。

圖.鳥類冠狀病毒遺傳進(jìn)化及跨種傳播的示意圖

該研究獲得了國家自然科學(xué)基金（32172943, 32370176，82221004）、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程（2023-I2M-2-001，2022-I2M-CoV19-002，2021-I2M-1- 038）、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃（2022YFE0210300）、科技基礎(chǔ)資源調(diào)查專項(xiàng)（2022FY100901）等項(xiàng)目的資助。我所吳志強(qiáng)研究員和華東師范大學(xué)何桂梅研究員為文章的共同通訊作者。華東師范大學(xué)博士研究生徐玉婷，我所助理研究員韓業(yè)林、博士研究生許盼盼、助理研究員周思宇為文章的共同第一作者。