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科研進展

楊威團隊在計算設計廣譜沙貝病毒中和抗體方面取得進展

發(fā)布日期:2023-09-07 字號:

2023年6月27日,我所楊威研究團隊在Journal of Virology雜志在線發(fā)表了題為“Broad Sarbecovirus Neutralizing Antibodies Obtained by Computational Design and Synthetic Library Screening”的研究論文。

沙貝病毒亞屬(Sarbecoviruses,又稱SARS相關病毒)成員包括人SARS-CoV、SARS-CoV-2和數(shù)百種遺傳上相關的蝙蝠冠狀病毒。SARS-CoV-2的持續(xù)進化大大增加了中和抗體藥物發(fā)生免疫逃逸的風險,同時也需加強防范動物病毒向人類溢出的風險。為提高當前及未來疫情的應對能力,亟需研發(fā)具有更廣泛保護性的新一代中和抗體。研究團隊系統(tǒng)分析了數(shù)十種沙貝病毒的RBD保守性,聚焦高度保守性表位,建立了全套基于結構的高性能計算設計流程和實驗驗證平臺。通過高性能計算與抗原抗體結構動態(tài)模擬技術,成功設計了一系列抗體,對代表性沙貝病毒RBD保持強親和力,假病毒實驗表明其能夠高效中和SARS-CoV、SARS-CoV-2各種VOCs,以及蝙蝠病毒RaTG13和WIV1等代表性毒株。值得注意的是其對近期廣泛流行的Omicron代表株BQ.1、BA.2.3.20和XBB等展現(xiàn)出改善的中和能力。動態(tài)模擬顯示新設計的抗體結合表位氨基酸位點在多種沙貝病毒種具有高度保守性,同時新設計的抗體與抗原相互作用也得到了加強。這些創(chuàng)新性研究方法與設計平臺的建立為針對具有高度變異特征的新發(fā)病原體抗體療法的快速開發(fā)具有指導意義。

圖. A.沙貝病毒RBD保守性分析;B.設計抗體結合抗原互作分析;C. 設計抗體針對不同沙貝病毒的中和效果

該研究獲得了中國醫(yī)學科學院醫(yī)學與健康科技創(chuàng)新工程項目(2021-I2M-1-038、2022-I2M-1-021),國家自然科學基金項目(U22A20553、82241064)等項目的資助。我所楊威研究員、遲曉靜副研究員是本文的共同通訊作者,博士研究生楊雪花、博士研究生段花蕊為本文的共同第一作者。

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