科研進展
候彭姣博士、郝煒助理研究員等在Nucleic Acids Research在線發(fā)表宿主限制因子Schlafen 11 核心結構與功能的研究
Schlafen (slfn)蛋白家族是哺乳動物體內受干擾素誘導表達的一類限制因子,在細胞免疫、分化以及抗病毒等多種生物活動中發(fā)揮重要作用。其中slfn11是該家族中最受關注的成員,不僅是腫瘤治療領域中一個顯著的生物標記,近年來多項研究報道也發(fā)現(xiàn),該蛋白能夠利用宿主與病毒蛋白表達密碼子偏好性不同的規(guī)律,抑制HIV-1等逆轉錄病毒在宿主細胞內的復制,然而該現(xiàn)象的具體分子機制仍不清楚。
2023年6月9日,中國醫(yī)學科學院病原生物學研究所崔勝團隊在Nucleic Acids Research在線發(fā)表了題為“Structural and biochemical characterization of Schlafen11 N-terminal domain”的研究論文。研究團隊首次解析了slfn11蛋白N端結構域(slfn11-N)的高分辨率晶體結構(2.69Å),該結構與目前已知的其它slfn蛋白高度類似。同時發(fā)現(xiàn)slfn11-N 呈現(xiàn)獨特的生化酶學特性,具有降解rRNA、I型與II型tRNA的RNase活性,但是更傾向于降解II型tRNA。而對于II型tRNA底物中對應不同密碼子的tRNA-Ser或tRNA-Leu, slfn11-N也表現(xiàn)出不同的酶解效率,進一步驗證了slfn11依賴密碼子偏好性不同,優(yōu)先抑制逆轉錄病毒蛋白等低CAI值蛋白表達的功能。通過細胞學實驗也再次驗證slfn11能夠在胞內抑制HIV-1 Gag與P24蛋白的表達。該研究同時也發(fā)現(xiàn),slfn11-N活性受其結構表面一系列關鍵位置的帶電氨基酸及其鄰近位點控制,這些關鍵氨基酸的不同組合,直接影響slfn11的酶活功能,利用這些規(guī)律甚至可以預測整個slfn家族其它蛋白的酶學活性。本研究的結果闡釋了slfn11抑制HIV-1 Gag等低CAI值蛋白表達的分子機制,為抗HIV-1和抗腫瘤新型蛋白藥物的研發(fā)提供了理論基礎。
圖. Sus scrofa SLFN11-NTD 降解核酸底物機制示意圖
中國醫(yī)學科學院病原生物學研究所崔勝研究員為本文通訊作者。崔勝課題組已畢業(yè)博士生候彭姣,助理研究員郝煒為本文共同第一作者。該研究得到中國醫(yī)學科學院醫(yī)學科技創(chuàng)新工程(2021-I2M-1-037),中央高?;究蒲许椖?3332021092)等項目的資助。