肺微生物組在肺結(jié)核的病理生理過程中起著重要的作用。目前只有少數(shù)基于16S rDNA擴(kuò)增子測序的研究報道，關(guān)于結(jié)核分枝桿菌和肺微生物組之間的相互作用有待進(jìn)一步深入研究。本研究利用鳥槍宏基組測序（shotgun metagenomic sequencing）系統(tǒng)分析比較了30例結(jié)核分枝桿菌陽性 (MTB+) 和30例結(jié)核分枝桿菌陰性(MTB-)肺結(jié)核患者支氣管肺泡灌洗液(BAL)的肺微生物組。

MTB+ 患者肺微生物組Alpha多樣性相比MTB-患者顯著降低。MTB+患者和MTB-患者肺微生物組Beta多樣性存在顯著差異。MTB+肺微生物組以MTB為主，而MTB-微生物組中富含Streptococcus, Prevotella, Nesseria, Selenomonas 和 Bifidobacterium，接近健康人肺微生物組成。網(wǎng)絡(luò)(Network analysis)分析表明MTB對肺微生物群落結(jié)構(gòu)有顯著影響。MTB+和MTB-群落表現(xiàn)出明顯的差異性功能特征。肺部真菌微生物群落也與結(jié)核分枝桿菌的存在與否有關(guān)。此外，本研究對16S rDNA擴(kuò)增子測序和鳥槍宏基組測序方法進(jìn)行了比較，結(jié)果證實了16S rDNA擴(kuò)增子測序嚴(yán)重低估了微生物組中結(jié)核桿菌的豐度，不適合肺結(jié)核桿菌相關(guān)微生物組學(xué)研究。

本研究首次利用宏基因組測序技術(shù)探索結(jié)核分枝桿菌與宿主菌群之間的相互作用。MTB+患者的肺微生物組中以MTB為主，而MTB-患者的肺微生物組中以鏈球菌富集為主。