細(xì)菌細(xì)胞外可收縮注射系統(tǒng)（extracellular Contractile Injection System, eCIS）是一種與噬菌體的可收縮尾部有著高度相似性的轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)。前期研究?jī)H在沙雷氏菌、發(fā)光桿菌和藤黃紫假交替單胞菌三種革蘭氏陰性菌中被實(shí)驗(yàn)鑒定。我所江峰博士等于今年4月在《Cell》雜志報(bào)道了首個(gè)完整的eCIS裝置（發(fā)光桿菌PVC系統(tǒng)）的精細(xì)結(jié)構(gòu)，進(jìn)一步揭示了這類轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)的作用機(jī)理和重要意義。

在此基礎(chǔ)上，楊劍課題組與北京友誼醫(yī)院及英國(guó)華威大學(xué)的研究人員合作，依據(jù)當(dāng)前已經(jīng)證實(shí)的三套eCIS系統(tǒng)的數(shù)據(jù)信息，通過(guò)基于隱馬模型的蛋白特征譜結(jié)合基因組排列關(guān)聯(lián)性分析，從源自公共數(shù)據(jù)庫(kù)的11,699株完整細(xì)菌基因組中成功鑒別出631個(gè)可能編碼eCIS的基因簇，并構(gòu)建了專用數(shù)據(jù)平臺(tái)。研究結(jié)果表明，eCIS廣泛分布于革蘭氏陰性菌、陽(yáng)性菌和古細(xì)菌中，并依據(jù)其排列方式和進(jìn)化關(guān)系可以被劃分為兩個(gè)譜系（包括六種亞型）。而前期研究鑒定出的三套eCIS系統(tǒng)均屬于其中的一個(gè)譜系內(nèi)的兩種亞型。有意思的是，現(xiàn)有完整細(xì)菌基因組中的eCIS和六型分泌系統(tǒng)（T6SS）的分布情況表明，這兩類系統(tǒng)極少同時(shí)存在于同一株細(xì)菌基因組中，暗示eCIS和T6SS之間可能存在關(guān)聯(lián)。更進(jìn)一步對(duì)來(lái)自EnteroBase數(shù)據(jù)庫(kù)的178,998株全基因組測(cè)序（WGS）草圖數(shù)據(jù)的系統(tǒng)分析還發(fā)現(xiàn)了143株可能攜帶eCIS系統(tǒng)的腸道沙門(mén)氏菌。該項(xiàng)研究為進(jìn)一步深入探索eCIS系統(tǒng)對(duì)細(xì)菌與宿主及環(huán)境的相互作用的影響提供了重要數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和分析平臺(tái)。