楊劍課題組
各實驗室介紹
課題組介紹
楊劍課題組是目前中國醫學科學院病原生物學研究所唯一專門從事生物信息學相關研究的團隊。課題組包括由研究員、副研究員、助理研究員和博士后等多人組成的核心科研團隊，專業涉及醫學、生物學、物理學、計算科學和生物醫學工程等多學科背景，注重學科交叉融合特色發展。近年來，課題組兼顧病原生物學基礎研究和傳染病防控重點需求。一方面，課題組通過大數據整合與挖掘、設計通用分類方案、開發在線識別系統和卷積神經網絡模型等，成功建立國際上最大的病原細菌毒力因子數據平臺VFDB，并先后揭示了細胞外可伸縮注射系統和毒素復合體等多種毒力因子的遺傳多樣性和結核分枝桿菌的耐藥性特征，通過生物信息學探索推動了相關病原菌的致病和耐藥機制研究；另外一方面，課題組面向新發傳染病防控重大需求，在國際上最早探索基于宏基因組的病原體高通量篩查數據挖掘新方法，并建立了全球首個重要疫源生物相關病毒數據平臺ZOVER，參與近年來的多次重大疫情相關病原體鑒定和數據分析，為我國新發傳染病疫情防控能力提升貢獻了力量。課題組近五年培養博士研究生5名，均按期畢業，其中1人次獲得國家獎學金、1人次入選北京市優秀畢業生、3人次入選北京協和醫學院優秀畢業生。